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A-1 Linux, Perl基礎

2015年9月17日(木)/9月18日(金)開講

    バイオインフォマティクスでは多くのデータベースや解析ツールがLinux上で開発されており、Linux環境において最新かつ多くのツールが利用できます。また、次世代シーケンサーの普及と共にこれまで以上に大量のデータを解析する必要が出てきていますが、Linux環境では大規模なデータを効率よく処理することが可能です。

    実習室

    本講義では、Windows と共存できる仮想環境(VMware Player)上での Linux OS(Ubuntu)を利用して、Linuxの基本操作とテキスト処理の実習を行います。 この環境は無料かつ手軽に利用でき、実践環境としても利用可能です。Perl基礎では、配列情報等の文字列処理に多用されているスクリプト言語Perlの基礎的なプログラミングの実習を行います。(実習環境は変更となる可能性があります。)
    ※UNIX/Linux の利用経験、プログラミング経験が無く、A-2 配列解析1A-3 配列解析2の受講を希望される方は、本講座も受講ください。

    この講座は、2度開催することとなりました。
    受講日の変更を希望される方は、希望される日の受講申込を行った後、先に申し込まれた際に配信された受付メール内のURLから受講申込をキャンセルしてください。手続きが不明な場合は事務局までお問い合わせ下さい。
    また、本講座の「Linux入門」については、近日中にe-learningコンテンツに追加される予定です(「Perlプログラミング基礎」は含まれません)。

    第1回 2015年9月17日(木)開催 受付終了
    第2回 2015年9月18日(金)開催 受付終了

    ※第1回、第2回ともに同じ内容です。


    開催日時 第1回 2015年9月17日(木)10:30~17:00(受付開始 10:00)
    第2回 2015年9月18日(金)10:30~17:00(受付開始 10:00)
    会場 産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー
    アクセスおよび周辺ランチマップ
    担当講師 水谷 健太郎(産総研 創薬基盤研究部門/東京大学大学院新領域創成科学研究科)
    定員 40名(最少催行人数 2名)
    受講要件 PCの基本操作(キーボード操作等)を行うことができること。
       > キーボードからのテキスト入力、マウスでウィンドウ操作やコピー・ペーストができる
    募集期間 2015年6月18日(木)~開講日3日前(9月15日(火)午前10時30分)
    お問い合わせ contactページよりお問合せください。
    講義・実習 Linux入門
          ・Windows と共存できる仮想マシン上でのLinux環境の作り方とその実行
          ・Linuxの基本操作(パスを通す, 解凍, コンパイル等)
          ・ファイルの作成と操作
          ・テキストファイルの操作:ファイルのダウンロード、ファイル分割などの操作

    Perlプログラミング基礎
          ・Perlプログラムの基本
          ・画面への文字出力, プログラム実行方法
          ・変数
          ・演算子と条件分岐
          ・配列
          ・制御構文を用いた反復処理
          ・文字列操作
          ・パターンマッチと正規表現
          ・プログラムへの入出力
          ・連想配列(ハッシュ
          ・サブルーチン
          ・BioPerlの紹介
    スケジュールおよび内容は、やむを得ない事情等により変更される場合があることをご了承下さい。

    過去実績

    2014年度 実績

    2013年度 実績

    2012年度 実績