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チュートリアル

2015年度 HPCI 講習会

2015年度 講習会

産総研 生命工学領域 創薬基盤研究部門では、2011年度より生命情報工学研究センター、ゲノム情報研究センターが実施してきたHPCI人材養成事業を継続してまいります。2001年設立の生命情報科学研究センター以来、研究活動だけでなく人材養成にも注力し、この間に培ってきたノウハウを活かして毎年カリキュラム構成を見直して、初心者にもわかりやすく丁寧な実習指導付きの講習会を開催してまいりました。実習には1人1台の備付けPC(Windows7)を使用します。講師は産総研の研究員をはじめ、第一線の研究者が務めます。

実習室
開設コース バイオインフォマティクス実習コース
HPCI チュートリアルセミナー
創薬インフォマティクス実習コース
お問い合わせ contactページよりお願いいたします。
※お申し込みは各講座の紹介ページ内よりお申し込みください。
パンフレット(2015年度版) >> ダウンロード

  • バイオインフォマティクス実習コース
  • - バイオインフォマティクスの基礎知識・実践技術を短期間に習得 -
    第一線の研究者が講師として、バイオ情報取り扱いの基礎理論から実際の解析研究までをテーマごとに指導します。計算機実習は1人1台の PC(Windows7)を利用し、講義と実習をバランスよく取り混ぜたカリキュラムで、バイオインフォマティクスの全容をつかむのに最適です。各単元は1日単位で講義・実習を行い、受講を希望するものだけを選択することができます。(受講に際し、前提となる知識や技術を設定した受講要件があります。最少催行人員 2人)
    本コースのカリキュラムは、これまで当センターで実施してきた生命情報科学技術者養成コース バイオインフォマティクス速習コースII、生命情報科学人材養成コンソーシアム バイオインフォマティクス実習コースのカリキュラムを元に企画し直しました。

    大量の配列データも怖くない!! Windows上の Linux 環境で高速・簡単に配列データ解析
    A-1 Linux, Perl基礎 2015年9月17日(木)/
    9月18日(金)
    A-2 配列解析1 ChIP-seqデータ解析およびENCODEプロジェクトなどによる既存のデータの活用 2015年9月30日(水)午後
    -10月1日(木)
    LASTによるさまざまな配列解析 2015年10月2日(金)
    A-3 配列解析2 配列モチーフ探索 2015年10月15日(木)
    フリーウェア 統計解析パッケージ R を使った NGS データ解析を基礎から学ぶ
    B-1 R基礎 2016年3月2日(水)
    B-2 Rで塩基配列解析:
    ゲノム解析からトランスクリプトーム解析まで
    2016年3月3-4日(木,金)
    B-3 多変量データ解析/遺伝子ネットワーク解析 2016年3月10-11日(木,金)

    受講要件
    ・ 以下のコンピュータの基本操作がスムーズにできる方
       > キーボードからのテキスト入力やマウスでのウィンドウ操作、コピー・ペースト等がスムーズにできる
       > 実習用PCのOSは Windows7 および仮想環境上の Linux です(備付のPCを使用して頂きます)
    ・ 社会人、学生いずれも可

    会      場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    受講申込:開催日の約3か月前から受付開始予定
                (本サイト上から/但し定員に達し次第受付終了)
    定      員:40名(先着順)
    受  講  料:無料

    実習サイト ==> リンク
    ・このサイトは、2015年度 バイオインフォマティクス実習コースを受講された方のみ利用可能です。
    ・ログインに必要なIDおよびPassは、講習会にてお知らせ致します。
    ・Pass(パスワード)は絶対に変更しないでください。

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  • HPCI チュートリアルセミナー
  • - 他機関とさまざまなチュートリアルを共催 -

    これまでの経験を活かし、全国各地で様々な講習会を開催してまいります。

    E-2 並列配列相同検索プログラム
    「GHOST-MP」講習会
    2015年10月30日(金)
    主催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
       人材養成プログラム(産総研 創薬基盤研究部門)
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    お問い合わせ contactページよりお願いいたします。

    会場:京都大学 宇治キャンパス 化学研究所 農学研究科会議室M-105(地図)
    受講料:無料(※参加には生命医薬情報学連合大会2015への参加登録(有料)が必要です。)
    受講申込:2015年9月1日(火)11時 受付開始(申込受付延長中)
    ※受講予約受付済みの分を除く空席・補助席は、当日先着順となります。
    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報



    D バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム
    次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会
    2015年7月22日-8月6日
    (7月31日(金)および土日を除く)
    主催 NBDC(バイオサイエンスデータベースセンター)
    東京大学大学院農学生命科学研究科
       アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
       人材養成プログラム(産総研 創薬基盤研究部門)
    情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
    お問い合わせ この講習会に関するお問い合わせは、
    NGS[AT]biosciencedbc.jpまでお願いします。
    なお、メール本文中に氏名および返信先メールアドレスを明記の上、お問い合わせ下さい。
    類似したご質問が大変多くなっております。お問い合せ前に必ず FAQ もご覧ください。

    会場:東京大学 農学部 2号館 2階 第1講義室(地図)
    受講料:無料
    受講申込:2015年4月20日(月)12時 受付開始
    受講定員:30名程度(応募者多数の場合、最大80名程度まで)
    * 応募者多数により受講定員を上回った場合は、抽選とさせていただきます(抽選方法は、主催者に一任させていただきます)。
    * 先着順ではありません。
    * 2014年度の講義を撮影したビデオが統合TVおよびYouTubeで公開されています(全15本)
    >> 動画リスト(2014年度 FAQ Q8_2.)

    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報

    * 2015年度の講義を撮影したビデオが統合TVおよびYouTubeで公開されました(全11本) >> 講義資料および動画リスト(NBDCのページ)


    E-1 遺伝子ネットワークの推計ソフトウェアSiGN-BNの講習会と実習 2015年7月13日(月)
    主催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
       人材養成プログラム(産総研 創薬基盤研究部門)
    公益財団法人都市活力研究所
    特定非営利活動法人バイオグリッドセンター関西
    お問い合わせ この講習会に関するお問い合わせは、
    scls-mado[AT]riken.jpまでお願いします。
    なお、メール本文中に氏名および返信先メールアドレスを明記の上、お問い合わせ下さい。

    会場:産総研 臨海副都心センター別館8階 コラボレーションコーナー(地図)
    受講料:無料
    受講申込:2015年5月21日(月)11時 受付開始
    受講定員:10名

    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報

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  • 創薬インフォマティクス実習コース (平成27年度のカリキュラムを終了しました)
  • - 創薬インフォマティクスの基礎知識を計算機実習を交えて短期間に習得 -
    創薬支援に必要なケモインフォマティクスとバイオインフォマティクスの実践的カリキュラムです。
    2015年度に開催する基礎コース(C-1コースおよびC-2コース)は各2日間で、創薬研究の初期探索段階を効率化するための分子モデリング技術(C-1コース)とバーチャルスクリーニング技術(C-2コース)に焦点をあてます。講義で基礎を押さえる「概論」(3コマ)、1人1台のPCを用いる「実習」(2コマ)、実践的な例を取り上げて紹介する「特論」(1コマ)で構成されます。(構成・内容は変更となる場合があります。また、受講に際し、前提となる知識や技術を設定した受講要件があります。)
    アドバンストコースは、基礎コースの内容を理解している方をおもな受講対象としたアドバンストコースは、分子動力学計算・GPCRモデリング・タンパク質-タンパク質 相互作用(PPI)・Post-Docking 解析 といったテーマを取り上げ、講義と実践的な例を用いた実習で計4日間の講習を行います。
    なお、2013年度 講義部分のみ e-learning (創薬インフォマティクス アドバンストe-ラーニングコース)に収録されています。
    (最少催行人員 2人)

    C-1 化合物情報概論・実習 東京 2015年7月2日(木)-7月3日(金)
    C-1_K 化合物情報概論・実習 大阪 2015年度の開催予定はありません
    C-2 インシリコスクリーニング概論・実習 東京 2014年7月9-10日(木、金)
    C-2_K インシリコスクリーニング概論・実習 大阪 2015年度の開催予定はありません
    C-3 アドバンストコース 東京 2015年7月30-31日(木、金)および
    8月6-7日(木、金)

    対象
    ・ 主に、タンパク質を標的とする医薬品・農薬等の化合物を設計・開発している企業等の研究職またはその経験者を対象としたカリキュラムになっています。
       > 関連する有機合成研究者やベンチケミスト、結晶構造解析などを業務とされる方々にもご好評を頂いてきた実績あるコースです。
       > ゲノムからのマーカー探索や診断薬設計を目標としたコースではありませんので、ご了承ください。
    ・ コンピュータの基本操作がスムーズにできる方
       >キーボードからのテキスト入力やマウスでのウィンドウ操作やコピー・ペーストがスムーズにできること。
       > 実習用PCのOSは Windows と Linux です(備付のPCを使用して頂きます)。

    東京会場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    受講申込:本サイト上から(2015年5月13日より受付開始予定)/但し定員に達し次第受付終了
    定      員:東京会場 20名(先着順、ただし同一機関から複数名のお申し込みを頂いた場合、調整をお願いすることがあります)
    受 講 料:無料

    ※創薬インフォマティクス実習コースは、「創薬分子プロファイリング研究センター」との共催です。
    ※創薬インフォマティクス実習コースは、「創薬等支援技術基盤プラットフォーム」の後援を受けています。

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