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チュートリアル

2011年度 HPCI チュートリアルセミナー

2012年3月8日(木) ~9日(金)

  • 次世代シークエンサーと共に歩む
    - 次世代シークエンサー データ解析入門 -

次世代シークエンサーを用いた研究では、読み取った配列データをどのように解析するかがポイントとなります。このチュートリアルでは、先進的な事例や、誰でも使えるウェブツールやフリーソフトを用いたデータ解析テクニックを紹介します。1人1台のPCを使用しながら、シークエンサー付属ソフトとは一味違った解析が体験できます。

実習室

対象
・  次世代シークエンサーを使用している、または使用する予定の方
   > 社会人、学生いずれも可
・ コンピュータの基本操作ができる方
   > キーボードからテキスト入力ができる、マウスでウィンドウ操作やコピー・ペーストができる
   > 実習用PCのOSは Windows と Linux です

受付終了
このチュートリアルの受講申込は、定員に達しました。
受講申込  2012年2月1日~2月28日(本サイト上から/但し定員に達し次第受付終了)
定      員  30名(先着順)
受  講  料  無料

お問い合わせは、contactページよりお願いします。

会場 産総研臨海副都心センター別館8階
生命情報工学研究センターコラボレーションコーナー
アクセス
講師(敬称略) 鈴木 穣
東京大学大学院新領域創成科学科 准教授
須山 幹太
九州大学生体防御医学研究所情報生物学分野 教授
京都大学大学院医学研究科 非常勤講師
マーティン フリス
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター 研究員
小山 芳典
産業技術総合研究所生物プロセス研究部門 主任研究員
門田 幸二
東京大学大学院農学生命科学研究科 特任助教

2012年3月8日(木)

時間 チュートリアル名 講師(敬称略)
10:30-10:40 開講にあたって 浅井 潔
ホームページ
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10:40-12:10
講義のみ
イルミナプラットフォームでの次世代型トランスクリプトーム解析
概要
鈴木 穣
ホームページ
昼食 (周辺ランチマップ)
13:30-15:30
実習あり
ChIP-seqデータ解析の基礎
概要Galaxy
須山 幹太
ホームページ
休憩
16:00-18:00
実習あり
Large-scale sequence comparison with LAST
概要LAST
Martin Frith
ホームページ

2012年3月9日(金)

時間 チュートリアル名 講師(敬称略)
10:30-12:00
講義のみ
SOLiD5500を用いてRoche 454 にせまるゲノム de novo アセンブルを1/10のコストで実現する
概要
小山 芳典
ホームページ
昼食 (周辺ランチマップ)
13:00-17:30
実習あり
Rでトランスクリプトーム解析
概要R
門田 幸二
ホームページ