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チュートリアル

2014年度 HPCI 講習会

2014年度 講習会

ゲノム情報研究センターは、前身である2001年生命情報科学研究センターの設立以来、人材養成事業を継続してまいりました。この間に培ってきたノウハウを活かして毎年カリキュラム構成を見直し、初心者にもわかりやすく丁寧な実習指導付きの講習会を開催します。実習には1人1台の備付けPC(Windows7)を使用します。講師はCBRCの研究員はじめ、第一線の研究者が務めます。

実習室
開設コース バイオインフォマティクス実習コース
HPCI チュートリアルセミナー
創薬インフォマティクス実習コース
お問い合わせ contactページよりお願いいたします。
※お申し込みは各講座の紹介ページ内よりお申し込みください。
パンフレット >> ダウンロード

  • バイオインフォマティクス実習コース
  • - バイオインフォマティクスの基礎知識・実践技術を短期間に習得 -
    第一線の研究者が講師として、バイオ情報取り扱いの基礎理論から実際の解析研究までをテーマごとに指導します。計算機実習は1人1台の PC(Windows7)を利用し、講義と実習をバランスよく取り混ぜたカリキュラムで、バイオインフォマティクスの全容をつかむのに最適です。各単元は1日単位で講義・実習を行い、受講を希望するものだけを選択することができます。(受講に際し、前提となる知識や技術を設定した受講要件があります。最少催行人員 2人) 本コースのカリキュラムは、これまで当センターで実施してきた生命情報科学技術者養成コース バイオインフォマティクス速習コースII、生命情報科学人材養成コンソーシアム バイオインフォマティクス実習コースのカリキュラムを元に企画し直しました。

    大量の配列データも怖くない!! Windows上の Linux 環境で高速・簡単に配列解析
    A-1 Linux, Perl基礎 2014年10月23日(木)/
    2014年10月28日(火)
    A-2 配列解析 2014年10月29-30日(水、木)
    効率的なWindows上のLinux環境で次世代シーケンサーからのデータを解析
    A-3 ChIP-seqデータ解析およびENCODEプロジェクトなどによる既存のデータの活用 2014年11月5-6日(水、木)
    フリーウェア 統計解析パッケージ R を使った NGS データ解析を基礎から学ぶ
    B-1 R基礎 2015年3月4日(水)
    B-2 Rでゲノム・トランスクリプトーム解析:CpG解析から機能解析まで 2015年3月5-6日(木、金)
    B-3 多変量データ解析/遺伝子ネットワーク解析 2015年3月12-13日(木、金)

    受講要件
    ・ 以下のコンピュータの基本操作がスムーズにできる方
       > キーボードからのテキスト入力やマウスでのウィンドウ操作、コピー・ペースト等がスムーズにできる
       > 実習用PCのOSは Windows7 および仮想環境上の Linux です(備付のPCを使用して頂きます)
    ・ 社会人、学生いずれも可

    会      場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    受講申込:開催日の約3か月前から受付開始予定
                (本サイト上から/但し定員に達し次第受付終了)
    定      員:40名(先着順)
    受  講  料:無料

    実習サイト ==> リンク
    ・このサイトは、2014年度 バイオインフォマティクス実習コースを受講された方のみ利用可能です。
    ・2015年2月19日より URL が変更になりました。これ以前にブックマークを入れていた方は更新をお願い致します。
    ・ログインに必要なIDおよびPassは、講習会にてお知らせ致します。
    ・Pass(パスワード)は絶対に変更しないでください。
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  • 創薬インフォマティクス実習コース (平成26年度のカリキュラムを終了しました)
  • - 創薬インフォマティクスの基礎知識を計算機実習を交えて短期間に習得 -
    創薬支援に必要なケモインフォマティクスとバイオインフォマティクスの実践的カリキュラムです。
    2014年度に開催する基礎コース(C-1コースおよびC-2コース)は各2日間で、創薬研究の初期探索段階を効率化するための分子モデリング技術(C-1コース)とバーチャルスクリーニング技術(C-2コース)に焦点をあてます。講義で基礎を押さえる「概論」(3コマ)、1人1台のPCを用いる「実習」(2コマ)、実践的な例を取り上げて紹介する「特論」(1コマ)で構成されます。(構成・内容は変更となる場合があります。また、受講に際し、前提となる知識や技術を設定した受講要件があります。)
    (最少催行人員 2人)

    特論の聴講について:大阪会場での特論(8月22日、29日)について、特論のみ参加を希望される方の聴講申込を受け付けます。講師・内容、申込受付は各講座のページをご覧ください。

    アドバンストコースについて:基礎コースの内容を理解している方をおもな受講対象としたアドバンストコースは、分子動力学計算・GPCRモデリング・タンパク質-タンパク質 相互作用(PPI)・Post-Docking 解析 といったテーマを取り上げ、講義と実践的な例を用いた実習で計4日間の講習を行います。 隔年開催予定のため、2014年度の開催予定はありません。ご了承ください。
    なお、2013年度 講義部分のみ e-learning (創薬インフォマティクス アドバンストe-ラーニングコース)に収録されています。

    C-1 化合物情報概論・実習 東京 2014年7月31日(木)-8月1日(金)
    C-1_K 化合物情報概論・実習 大阪 2014年8月21-22日(木、金)
    C-1_KT 化合物情報特論 大阪 2014年8月22日(木、金)
    C-2 インシリコスクリーニング概論・実習 東京 2014年8月7-8日(木、金)
    C-2_K インシリコスクリーニング概論・実習 大阪 2014年8月28-29日(木、金)
    C-2_KT インシリコスクリーニング特論 大阪 2014年8月29日(金)
    C-3 アドバンストコース 2014年度の開催予定はありません

    対象
    ・ 主に、タンパク質を標的とする医薬品・農薬等の化合物を設計・開発している企業等の研究職またはその経験者を対象としたカリキュラムになっています。
       > 関連する有機合成研究者やベンチケミスト、結晶構造解析などを業務とされる方々にもご好評を頂いてきた実績あるコースです。
       > ゲノムからのマーカー探索や診断薬設計を目標としたコースではありませんので、ご了承ください。
    ・ コンピュータの基本操作がスムーズにできる方
       >キーボードからのテキスト入力やマウスでのウィンドウ操作やコピー・ペーストがスムーズにできること。
       > 実習用PCのOSは Windows と Linux です(備付のPCを使用して頂きます)。

    東京会場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    大阪会場:産総研 関西センター 高分子化学実験棟2階会議室(アクセス
    受講申込:本サイト上から/但し定員に達し次第受付終了
    定      員:東京会場 20名、大阪会場 5名(特論聴講のみ 12名)(先着順)
    受 講 料:無料

    ※創薬インフォマティクス実習コースは、「創薬分子プロファイリング研究センター」との共催です。
    ※創薬インフォマティクス実習コースは、「創薬等支援技術基盤プラットフォーム」の後援を受けています。
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  • HPCI チュートリアルセミナー
  • - 他機関とさまざまなチュートリアルを共催 -

    これまでの経験を活かし、全国各地で様々な講習会を開催してまいります。

    主催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    人材養成プログラム(産総研 ゲノム情報研究センター)
    後援 理化学研究所 情報基盤センター
    バイオスーパーコンピューティング研究会
    F-2 並列配列相同性検索プログラム「GHOST-MP」講習会
    2015年3月20日(金)
    13:00~16:30
    お問い合わせ contactページよりお願いいたします。

    会  場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    受 講 料:無料
    受講申込:2015年1月13日(火)11時~2015年2月27日(木)13時(先着順)
         2015年1月14日(水)11時~2015年2月27日(木)13時(先着順)
         * 都合により募集受付開始日が変更となりました。ご了承ください。
    定  員:10名(キャンセル待ちの予定はありません)


    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    E 生命医薬情報学連合大会2014
    チュートリアルセッション
    中級者向けバイオインフォマティクス入門講習会
    フリーソフトRを用いたビッグデータ解析:
    塩基配列解析を中心に

    ※ 終了しました
    2014年10月4日(土)
    お問い合わせ contactページよりお願いいたします。

    会場:宮城県仙台市 仙台国際センター 2階 小会議室4(アクセスマップフロアマップ
    受講料:無料(※参加には生命医薬情報学連合大会2014への参加登録(有料)が必要です。)
    受講申込期間:2014年7月22日(火)午前11時~2014年8月18日(月)10時30分
    ※受講予約受付済みの分を除く空席・補助席は、当日先着順となります。

    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報


    主催 NBDC(バイオサイエンスデータベースセンター)
    東京大学大学院農学生命科学研究科
       アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
       人材養成プログラム(産総研 ゲノム情報研究センター)
    情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
    日本DNAデータバンク(DDBJ)
    D バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム
    (次世代シークエンサ)速習コース

    ※ 終了しました
    2014年9月1-12日(土日を除く)
    お問い合わせ この講習会に関するお問い合わせは、
    nbdc-tutorial-ml[AT]aist.go.jpまでお願いします。
    なお、メール本文中に氏名および返信先メールアドレスを明記の上、お問い合わせ下さい。
    類似したご質問が大変多くなっております。お問合せ前に必ず FAQ もご覧ください。
    受講できなかった方へ:公開可能な講義資料等はこちらからご覧ください==>FAQ Q8.

    * 講義を撮影したビデオが統合TVおよびYouTubeで公開されました(全15本) >> FAQ Q8_2.

    会場:東京大学農学部2号館2階第1講義室(地図)
    受講料:無料
    受講申込:全日程受講申込は満席のため受付を終了し、一部日程の受講申込は行いませんのでご了承ください。TAとしての参加申込は受け付けています。

    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報


    主催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    共催 HPCI戦略プログラム分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
    人材養成プログラム(産総研 ゲノム情報研究センター)
    理化学研究所 情報基盤センター
    特定非営利活動法人バイオグリッドセンター関西
    後援 バイオスーパーコンピューティング研究会
    F-1 だれにでもわかる拡張サンプリングシミュレーション ―実習編―
    ※ 終了しました
    2014年7月24日(木)
    ※一部のご案内では開催日を火曜日と誤って表記しておりました。 正しくは24日 木曜日です。訂正してお詫び申し上げます。
    お問い合わせ scls-mado[AT]riken.jpまでお問い合わせください。
    ([AT]を小文字アットマークにかえて下さい。またメール本文中に氏名および返信先メールアドレスを明記の上、お問い合わせ下さい。)

    会  場:産総研 臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー(アクセス
    受 講 料:無料
    受講申込:2014年7月1日(火)11時~2014年7月17日(木)13時
    定  員:10名(先着順)

    この講習に関する詳しい情報および受講申込はこちらをご覧ください >> 詳細情報

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    2012年度 実績

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